水系統中央空調又叫“環保空調”、“水冷空調”，之所以叫“水冷空調”的原因，是因為這一類型中央空調機組主要以水為熱傳遞介質來進行熱交換已達到制熱和降溫的目的。
水系統中央空調機組制冷原理：
水系統中央空調啟動后，壓縮機啟動，氟里昂通過冷熱循環把冷氣打到室外機的冷凝翅片上，然后包含著水的水管經過密密麻麻的冷凝翅片，帶走冷凝翅片上的溫度，送進室內。在到達室內機的時候，再一次跟室內機上的冷凝翅片發生換熱。最終，用室內機里的鼓風扇將冷凝翅片上的冷量吹出，達到制冷、熱的目的。
水冷中央空調降溫原理是:根據"水蒸發吸收熱量，蒸發面積影響蒸發效率"這一自然物理現象，當風機運行時冷氣機腔內產生負壓，使機外空氣流進多孔濕潤的濕簾表面進入腔內，空氣與水份充分接觸的同時使濕簾上的水蒸發，帶走大量顯熱，使經過濕簾的空氣干球溫度降至接近于機外空氣的濕球溫度，即冷氣機出口的干球溫度比室外干球溫度低5-12℃(干熱地區可達15℃)，空氣愈干熱，其溫差愈大，降溫效果越好,同時由于環保空調該機利用蒸發降溫原理，因此，環保空調具有降溫和增濕雙重功能。
水系統中央空調機組優點：
一、水機的初期投入較低。(因為不象氟機組必須用銅管連接，機器內在也有細微的不一樣。)
二、舒適度較好(但是我不這么認為，因為我覺得水機里面的水是在水管里面，是不可能入戶的。試問如何能達到濕潤的舒適要求?)(只能說水機因為沒有氟機組制冷、熱來的快，因此循環風量做的較大，相對出風感覺較均勻。)
三、可以與鍋爐對接，提升制熱的效果。
水系統中央空調機組缺點：
一、水機制冷、熱速度相對氟機而言，速度比較慢。(因為氟和水的化學性質本身就不一樣，氟在常溫下就可以蒸發。而水大家都知道，需要到100度才能蒸發。)冷、熱交換速度不一樣。
二、存在一定的漏水隱患，因為水管不可能象銅管那樣做到40公斤左右的泄露保壓測試。
三、制冷原理的不一樣，造成了水機相對氟機而言，室內、外機噪音較大，因為需要加大循環風量彌補制冷、熱速度慢的不利，所以機器不得已要改型，機器內機做的較大。外機噪音大的原因，因為機器內部結構相對比氟機復雜，因此機器外機做的也較大。
制冷、熱速度相對氟機而言較慢。
耗電量相對氟機而言較大。因為氟機是一次換熱;水機是二次換熱，加上鍋爐就是三次換熱了。換熱越多，耗電越大。
使用成本相對氟機而言較高。耗電日后維修成本加高，因為水系統機器比氟系統機器結構上復雜/不管是用水管還是銅管連接，都必須定期清洗管道保養，否則，水垢加劇因水流量變小造成的耗電。
冬天如果不配套鍋爐效果相對氟機而言，不會太好。